自然妊娠时，生化妊娠有时候能发觉，是因为提早做了化验；有时候没有发觉，因为月经来了，生化妊娠就走了，什么也没有留下。

生化妊娠，是指胚胎已经着床，胚胎滋养细胞分泌的HCG已进入母体血液，并达到可在尿或血液中检测出的水平；但是之后由于某种原因，胚胎没能持续健康生长就枯萎了，血中的HCG也随之下降。正因为怀孕仅进行到能通过生物化学方法可以检测的阶段，还没有发展到能用B超检查出孕囊的阶段，所以称“生化妊娠”；如果妊娠持续至B超检查能在宫腔内发现孕囊的阶段，就称为“临床妊娠”。

生化妊娠的原因

胚胎本身有缺陷。由于遗传因素导致染色体数目或结构异常，导致胚胎发育不良。一般认为胚胎染色体异常可能是导致生化妊娠的主要原因，在怀孕前三个月的偶发早期流产中，超过50%的流产原因也是染色体异常。

卵巢中黄体功能不全。黄体不好，导致黄体酮分泌不足，子宫内膜异常，影响胚胎在子宫内的着床。进行试管婴儿助孕的女性，这个顾虑几乎没有，因为医生会给予足够的药物进行黄体支持。
 

子宫因素。子宫发育不良、子宫内膜很薄、子宫内膜息肉、子宫内膜结合、宫腔粘连、子宫黏膜下肌瘤等都会影响胚胎的着床。

外界因素影响。吸烟（包括二手烟）、饮酒、接触化学性毒物、严重的噪声和震动、情绪异常波动（愤怒、过喜、过悲或过度惊吓）、高温环境等，可导致胎盘和胚胎受损，造成生化妊娠或流产。

疾病或病毒。怀孕前后体内感染细菌或病毒，细菌或病毒会对卵细胞、受精卵、胚胎造成影响，影响其发育，也会造成生化妊娠或流产。

营养缺乏。可能是一次不知场所的胚胎着床，因为太早，无法确定是不是在输卵管或子宫腔正常位置以外的其他部位，可能因为营养供应不良而生化了。

母体代谢异常或免疫异常。如多囊卵巢综合征的糖脂代谢异常没有得到纠正。同种免疫和自身免疫异常，都可能是生化妊娠的原因。

偶尔的生化妊娠在某种意义上来说是自然的选择，物竞天择，适者生存，优胜劣汰。但是，如果反复生化妊娠，3次及以上的生化妊娠，最好要找出原因。